通过改进测序数据分析揭示“隐形”细胞类型和基因表达


2018年,加州理工学院陈氏奖学金学者、生物学教授、传统医学研究所研究员Yuki Oka实验室的研究人员取得了一项重大科研进展:他们发现了一种介导饮水满足感的神经元或脑细胞。但他们遇到了一个问题:一种名为单细胞RNA测序(scRNA-seq)的先进技术无法在脑组织样本中找出那些与口渴相关的神经元。这些脑组织样本主要来自视前内侧核(medial preoptic nucleus),学界普遍认为该脑区含有此类神经元。

识别不同的细胞类型对于了解我们身体的众多功能至关重要。例如,许多研究人员目前正在寻找可能与特定疾病(如帕金森病)有关的细胞类型。确定参与这些过程的精确细胞类型对以上所有研究都很重要。现在,加州理工学院的Yuki Oka实验室与德克萨斯大学西南医学中心的Allan-Hermann Pool实验室合作,证明了如何优化scRNA-seq分析中的一个关键步骤,以恢复缺失的细胞类型和基因表达数据(通常会被废弃)。

与该研究相关的论文已于9月11日发表在了Nature Methods期刊上。

前往官网阅读原文