加州理工学院开发的一种全新软件算法,使研究人员能够轻松在 RNA 序列数据中搜索病毒,从而检测样本中的病毒,并研究它们对生物功能的影响。
地球上存在的病毒数量几乎无法想象:据估计,每一颗宇宙中的星星对应约一千万个病毒个体。病毒无处不在,即使它们并未引发疾病。关于病毒如何影响我们日常生活,还有许多尚未解答的问题。例如,有理论认为某些神经退行性疾病(如阿尔茨海默症和帕金森症)可能源于病毒感染。
这项新算法基于现有软件工具 kallisto 构建,能够揭示此前“隐形”的病毒世界运作方式。
本研究由加州理工学院 Bren 计算生物学、计算与数学科学教授 Lior Pachter 实验室主导完成,相关论文已于 DATE 发表在《Nature Biotechnology》期刊上。